E! DAL Plant Phenomics and Genomics Research Data Repository

fra Wikipedia, den gratis encyklopædi
Spring til navigation Spring til søgning

E! DAL - Plant Genomics and Phenomics Research Data Repository (PGP) er et omfattende lager til offentliggørelse af flerdomæne planteforskningsdata[1] . Det drives på Leibniz Institute for Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) i Gatersleben og indeholder datasæt, der kan refereres til med DOI'er , som hovedsageligt ikke offentliggøres i andre databaser på grund af deres volumen eller type. PGP muliggør offentliggørelse af meget store datasæt og er registreret som forskningsdatabase på FAIRSharing.org og re3data.org og registreret som et OpenAIRE -gyldigt EU Horizon 2020 -arkiv. PGP opfylder FAIR -dataanbefalingerne "findes", "tilgængelige", "interoperable", "genanvendelige". PGP -depotet er baseret på e! DAL [2] -infrastruktursoftwaren og følger en "bring infrastrukturen til data" (I2D) tilgang.

Database

Alle gennemgåede og offentliggjorte data gemmes på IPK Gatersleben og får en DOI for langvarig henvisning.

Indsendelse af data

PGP accepterer data fra det europæiske planteforskningssamfund.

Tysk netværk for bioinformatikinfrastruktur (de.NBI)

E! DAL-PGP-depotet er en del af serviceporteføljen til GCBN-noden (German Crop BioGreenformatics Network) i de.NBI- netværket.

Individuelle beviser

  1. Daniel Arend, Astrid Junker, Uwe Scholz, Danuta Schüler, Juliane Wylie, Matthias Lange: PGP -depot: en plantefænomik og genomisk datapublikationsinfrastruktur . I: Database . 2016, nr. Baw033, 16. april 2016, s. Baw033. doi : 10.1093 / database / baw033 . PMID 27087305 . PMC 4834206 (gratis fuld tekst).
  2. Daniel Arend, Matthias Lange, Jinbo Chen, Christian Colmsee, Steffen Flemming, Denny Hecht, Uwe Scholz: e! DAL - en ramme til lagring, deling og offentliggørelse af forskningsdata . I: BMC Bioinformatik . 15, nr. 1, 2014, s. 214. doi : 10.1186 / 1471-2105-15-214 . PMID 24958009 . PMC 4080583 (gratis fuld tekst).